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二号机和明日香的到来，预示着第三新东京市的NERV总部的力量又增添了一份，歼灭使徒的保证又提高了许多。
不过同时，这个傲娇而又强势的少女却也给小受同学带来了不少麻烦，过上了痛并快乐着的生活。
同时，双面间谍加持良治从国外给碇源渡带来了「人类补完计划」至关重要的“尼布甲尼撒之钥”，预示着「人类补完计划」即将正式进入下一个阶段。然后，这个男人就在总部四处乱逛，粘花拈草，种瓜浇水，一副庄园农民的做派。
零观在乱逛的时候曾经见过他几次，这个男人不愧是搞情报的高手，不着痕迹的打听过他的情报。然而可惜的话，任他怎么查零观都不怕，除了实力做后盾以外，还因为他根本就不是这个世界的人，累死他也找不到零观的情报。
过了几天，第三新东京市的海洋生物保护区对外开放，原本应该邀请小受同学、三无少女、傲娇少女三位EVA驾驶员以及他们两位同学去参观的加持良治却并未作出与原剧情一样的举动，零观感觉奇怪，正好呆在基地里闲着也是闲着，索性就自己邀请五个少年少女去那里转转了。
由于特殊的身份，以及相互直接的接触还算愉快，三个驾驶员都接受了零观的邀请，在言明可以带朋友一起去的情况下，笨蛋三人组的另两位，以及迅速和明日香拉近关系的班长少女，还有葛城美里饲养的温泉企鹅也都一同来了。
第二次冲击爆发之后，地球出现了明显的扭曲现象，最明显的就是天气异常，海洋变成了红色，原本的海洋动植物除了人类及时保护起来的那些，其他的全都灭绝，导致全球氧气不足，土地荒漠化十分严重。
为了维持人类的生活，也为了让这些种群生存繁衍下去，各国政府人工制造氧气，甚至花费了巨大的代价修建了保护陆地动物以及飞禽的巨大动物园和保护海洋生物的巨大水族馆，同时缅怀以前的美好世界。
以人类现在拥有的科技，是能够净化红色海水中的LCL的，不过花销实在太大，各国也就只在自己地盘内修建了巨大的海水净化厂，将红色海水变为蓝色海水，然后用这些海水供给海洋生物生存。
由于天气的异变，空气中有着非常多的辐射和有害物质，人类在日常生活中难免身上会有携带，为此，在进入水族馆之前，所有人都得经过好多道消毒或者监测等处理程序，之后才能见到他们从来没有见到过的水族馆。
零观当然没有必要接受这些程序，直接来到入口处等着他们。
然后，一行人正是进入水族馆。
第三新东京市这里的水族馆是仿照现实里大阪水族馆设定的海洋保护区，规模庞大不说，海水中还生活着各种各样现代人根本已经见不到的海洋生物。它们虽然不像在海洋里生活那样自由，但是能活着未尝不是一件幸福的事。
花花绿绿的鱼群在玻璃那一侧游动着，来回穿梭，更有各种各样说不上名字的生物在好奇的看着这边，一切看起来都是那么的精彩。
如果是一般的学生来到这里，早就和笨蛋三人组中除小受同学以外的两人以及班长少女一样接连发出欢天喜地的大叫声了，只可惜三个EVA驾驶员都算不上一般的学生，绫波丽三无，碇真嗣淡然顺从，明日香傲娇外加傲慢，反应明显不同于正常人，让尽管有心理准备的零观仍是郁闷了一把。
此时此刻，他终于理解了那种卖萌兔子的感受了。
问题儿童果然非常难搞！！！
在几个少年少女观赏另一边的海洋生物的时候，绫波却独自一人走到一边，静静地看着被小器皿培养着的一群小鱼苗，手掌贴在透明的屏壁上。
“绫波——”
小受同学走过来，关切的问道：“你怎么了吗？”
“没什么。”绫波丽收回手掌，红色的眸子落到少年身上，眼神中闪过一丝落寞，“只是觉得……它们和我一样。”
“什么？”小受同学下意识的疑惑道。
绫波丽转头看着身前的玻璃样器皿，以及水中生活着的鱼，轻轻说道：“除了这里，根本没有能够存活下去的地方了。”
“绫波——”
小受同学清楚的感受到了绫波的感情波动，但是一向自闭，只是刚刚有所好转的他现在可说不出合适的话来，无言的看着少女。
“喂喂喂，这种悲伤的话题可不是你们这种小家伙该讨论的。”这时候，恰巧听到这话的零观笑着走了过来。
“！”
绫波丽淡淡的看着零观。
零观淡然笑道：“你以为它们只能生活在这里？错了，它们可以生活在更广阔的地方。鱼都是如此的话，身为人类的你自然也是一样。”
“人类……”绫波丽喃喃自语着。
“更广阔的的地方？”小受同学诧异道，“刚刚工作人员不是说了，地球上的海水已经严重污染，海洋生物根本无法生存在大自然中吗？哪里还有更广阔的地方？你说的是更大的水族馆还是容器？”
“看来你们知道的情报真的很少啊。嗯，看这些被人类圈养的生物的确有些无聊……好吧，作为招待，我到你们去看一些绝不多数人还看不到的美景。一会儿到了地方，可别太多惊讶哦。”
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