人类全体被彻底封存，舰队在智慧生命的控制下继续遥远的旅程。
没有人类的参与，很多事情都不得不停顿下来，像是五级科技的解析，仅凭大黄蜂等几个有限的智慧生命科学家就很难获得实质性的推进。
为了尽快解决目前的困境，大黄蜂将仅有的几个智慧生命科学家全部投入到灵魂病毒的研究中，甭管专业对不对口，现在是赶鸭子上架，不行也得行。没了弥补智力资源的不足，大黄蜂从智慧生命中挑选了一下科研倾向比较强的，将他们同样加入研究队伍中。
人类封存了，但是舰队内仍然存在大量的其他生命，首先是多弗战俘，这种好像是大号海星的生物同样可以拿来当实验体。
事实证明，多弗海星并不能因为种族和基因的不同，而免疫灵魂病毒。只不过海星感染后的疯狂模样与人类稍有不同而已，但是同样是失去意识，变成简单思维的活体。
趁着多弗海星还没有全部被感染，大黄蜂将将健康海星分散到所有战舰上，以此观察灵魂病毒的感染范围的扩散情况。
根据海星的感染情况，大黄蜂绘制出一份随着时间变化的感染图景。从这幅动态图上明显能够看出，一地球号生活舰为中心，灵魂病毒逐步向周围的战舰蔓延。
很奇怪的，很多战舰之间完全没有任何物质、能量甚至信息交换，但是灵魂病毒就是这么凭空跨越虚空，从一艘战舰蔓延到另一艘战舰上。
只用了两年多时间，整个舰队就彻底被灵魂病毒笼罩，所有未被及时封存的多弗海星都没能幸免，全部成了海星疯子。
海星成了疯子，战舰中另外一个生命同样没能幸免，那就是铁钦族。随着病毒的传播，铁钦族很快被病毒笼罩起来。
铁钦族完全对灵魂病毒一事无知无觉，因为人类进入曲率航行状态，开始超远距离旅行之后，灵魂病毒才爆发出来，这个过程中铁钦族只和人类有信息沟通。所有他们一直不知道有灵魂病毒这个灾难发生。
因为吴辉的叮嘱，同样因为需要观察病毒对铁基生命的效果，大黄蜂刻意的任由他们暴漏在灵魂病毒的侵染之下。
事实证明，铁基形态不不能让铁钦族在灵魂上有什么不同，他们仍然毫无意外的成为铁基形态的疯子。
为了预防万一，大黄蜂封存了不少多弗海星和铁钦族，留作以后的实验样本。虽然吴辉有授权，可以拿人类做实验体，但是既然有其他生命存在，大黄蜂还是觉得，拿他们当实验体比较没有心理障碍。
多弗海星成为实验体，进行各种极端的灵魂病毒实验。同时大黄蜂也没忘记继续寻找索荅，既然索荅能够赋予金城舞异能，能够帮助他发现病原体，那么她也许就会有办法收拾这个灵魂病毒。
大黄蜂组织智慧生命认真分析了索荅的所有影像记录，通过这些分析，大家得出一个结论。索荅应该跟金萱感情很好，因为俩人自从相识之后，一直同吃同住，形影不离，俩人志趣非常相似。
大黄蜂根据这点，专门设计了一个手段，打算将索荅引诱出来。大黄蜂推测，金萱应该还在舰队内，只不过躲起来不愿意出来而已。
大黄蜂制作了一套全息影像，影像里都是索荅和金萱俩人一起生活的点点滴滴，俩人所有快乐都被浓缩在这段影像里。
全息影像开始在舰队内部各个角落反复播放，在影像的最后，大黄蜂加入了人类目前面临的巨大威胁，请求索荅来救救金萱，救救整个人类。
影像播放的第一天没有任何反应，第二天同样没有任何反应，第三天的时候终于有了变化。
这天大黄蜂正在内部网络上处理舰队事情。
“你是人类这支舰队目前的领导者？”一个中年人突然出现在他面前。
大黄蜂听到声音，吃惊的抬起头来，这个人如此突兀的出现在面前，事先没有任何征兆。大黄蜂立刻启动探测装置扫描了一下这个中年人，结果他发现，他面前实际上只是个全息影像。
“您是？”
“我是索荅的父亲！我叫尼希。”
“……”大黄蜂被这个回答惊呆了，试探着问他的来意。“……那么您？”
“你不是在寻求帮助吗？”
大黄蜂愣了一下，马上忙不迭的点头。“对！对！对！”
“本来我是无所谓的，不过索荅要我帮帮你们，所以我就来了。”
“那……索荅她人呢？”
“她啊，被我关起来了，她总是翘家，这次一定要给她一点教训。”
“哦~~”大黄蜂最关心的还是灵魂病毒，“您有办法治愈灵魂病毒？”
“其实呢，那个东西不应该叫做灵魂病毒，它应该叫做虚空蠕虫。”
“虚空蠕虫？”大黄蜂对这个名字非常疑惑，不过对面这个中年人应该知道来龙去脉。
“虚空蠕虫以智慧生命灵魂为食，你们所说的感染、疯子，其实是被这种蠕虫种植了虫卵。如果你们不采取封存措施的话，所有感染者最终都会死亡，并且孕育出一个新的蠕虫。”
“这个……虚空蠕虫是从哪里来的？”
“你们以后自然会知道的——如果你们能够走到那一步的话，否则你们即使知道了，也没有任何好处。”
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